31 декабря 1942 года отец Сергий Астахов скончался в лагере.

19 июля 1989 года он был реабилитирован Прокуратурой Московской области. По представлению Московской епархии, «Определением от 17 июля 2001 года» Священного Синода, Сергей Николаевич Астахов канонизирован Архиерейским Собором Русской Православной Церкви. Память совершается 31 декабря (18 декабря по ст. ст.), в Соборе новомучеников и исповедников Российских и в Соборе новомучеников Богородских.

День памяти: сщмч. диакона Сергия Астахова — 31 декабря.